VASP入門到精通

VASP入門到精通:[18]VASP分子動力學計算

VASP入門到精通:[18]VASP分子動力學計算
這一節介紹分子動力學的計算方法 工具/原料 VASP 方法/步驟 首先,做分子動力學的模型要原子足夠多,可以建立超胞來處理 比如小編可以在MS中做一個超胞,然後導出坐標,步驟如下: 打開MS,建立初始模型,這裡小編以TiO2為例 點擊 build-symmetry-supercell,因為小編的晶胞 ...

vasp入門到精通[28]計算轉動慣量(單質立方相)

vasp入門到精通[28]計算轉動慣量(單質立方相)
這一節分享一個小腳本,計算3個方向的轉動慣量,一般伺服器里都是默認裝了python的,腳本小夥伴直接拿去用吧. 工具/原料 python vasp 方法/步驟 先把代碼貼出來: 使用方法: 輸入命令 python 腳本名字 文件名字(你的POSCAR) 比如小編給自己的POSCAR重命名為" ...

vasp入門到精通[30]計算雜化勢

vasp入門到精通[30]計算雜化勢
這一節介紹雜化勢的計算 工具/原料 vasp 方法/步驟 計算雜化勢需要比較多的計算資源,比較費時,所以大家提交的腳本里,時間設置長一些: 先介紹PBE0的參數,INCAR如下: 其實就是HF計算 介紹HSE06的參數,INCAR如下: 就是在PBE0的基礎上加了一個參數 HFSCREEN=0.2 ...

VASP入門到精通:[5]VASP輸出文件(1)

VASP入門到精通:[5]VASP輸出文件(1)
這一節一起來看一下VASP計算完成後的輸出文件吧 工具/原料 VASP 方法/步驟 VASP的主要輸出文件如下: 這裡先講一下主要的輸出文件: OUTCAR:主要的輸出文件,裡面有計算的參數和每一個循環步驟的輸出結果 裡面含有每一步驟的能量結果,位置,力收斂標準,能量收斂,電荷,磁矩等信息 如上圖, ...

vasp入門到精通[21]計算電極化,Born有效電荷

vasp入門到精通[21]計算電極化,Born有效電荷
好久不見了,這一節小編給大家介紹如何計算電極化,born有效電荷. 參照manual,這裡使用NaF作為例子 工具/原料 vasp,計算腳本 方法/步驟 第一步優化,正常優化結構,注意精度要高一些輸入文件如下圖 建議加入額外參數: ISTART=0 ICHARG=2 IBRION =2 NSW =4 ...

VASP入門到精通:[10]VASP計算能帶(2)

VASP入門到精通:[10]VASP計算能帶(2)
syml文件的寫入和能帶的計算 工具/原料 VASP,syml,band.x 方法/步驟 這裡繼續上一節內容,就是關於syml的內容 第一行數字4,表示有多少個高對稱點,這裡小編取得4,這裡小編找了3個高對稱點,G--X--S--G 這裡可以用MS找到高對稱點,也可以從文獻里找到高對稱點 下一步就是 ...

VASP入門到精通:[15]VASP計算應力(1)

VASP入門到精通:[15]VASP計算應力(1)
應力對材料的性質有重要影響,比如隨著應力的不同,磁性材料的基態可能會發生變化 對應力進行掃描計算,可以找到最穩定的晶格常數 工具/原料 VASP 方法/步驟 首先,應力的改變,在計算中的直接體現就是晶格常數 改變晶格常數,做一個掃描計算,便是應力的檢測計算,包括晶格常數的最優化確定 如上圖所示,a ...

VASP入門到精通:[13]VASP 的LDAU計算

VASP入門到精通:[13]VASP 的LDAU計算
U用於處理電子之間強的庫倫相互作用. Hubbard U 工具/原料 VASP 方法/步驟 上一節說倒磁性計算,先給小夥伴看下小編的計算結果文件 上圖是小編的OSZICAR文件,裡面有輸出結果和總的磁矩,下圖是OUTCAR,標註的部分是每個原子的磁矩 有時候對於d軌道或者f軌道的計算往往不都準確,這 ...

VASP入門到精通:[17]什麼是態密度DOS

VASP入門到精通:[17]什麼是態密度DOS
這一節講一下態密度的問題 方法/步驟 態密度:電子在對應能量的數量比,比如下圖,在-23eV左右有一個峰值,意味著這裡有較多的電子分布,縱坐標表示相對數量,只是一個相對值 要知道態密度是怎麼回事,首先要知道電子軌道的問題 電子軌道分軌道量子數和角量子數,自旋量子數.小夥伴不懂的也沒關係,小編簡單的解 ...

VASP入門到精通:[6]VASP輸出文件(2)

VASP入門到精通:[6]VASP輸出文件(2)
這一節講一下DOSCAR文件,OSICAR等 方法/步驟 DOSCAR文件內容如下 具體參數和意義如下 CHG和CHGCAR 這兩個文件是電荷密度的文件,具體如下: 其中CHGCAR中的數據可以用來處理電荷密度圖,電荷差分密度圖ELF等信息都可以從這個文件中處理出來 EIGENVALUE 本徵值,具 ...

vasp入門到精通[35]查看收斂情況(腳本)

vasp入門到精通[35]查看收斂情況(腳本)
這一節小編教大家寫一個腳本來查看收斂情況 工具/原料 vasp,linux shell 方法/步驟 有時候我們想看一個比較大的體系的收斂情況,往往要跑很多離子步,你怎麼才能看到能量的收斂情況呢? 比如小編的例子,有69個原子.而且小編的原子位置猜測的可能不合理,這樣的話vasp會跑很多步,但是我怎麼 ...

VASP入門到精通[32]態密度和HOMO-LUMO

VASP入門到精通[32]態密度和HOMO-LUMO
這一節小編寫了個小腳本,提取DOS和HOMO-LUMO能級 工具/原料 vasp linux 方法/步驟 注意:這2個腳本是針對ISPIN=2的計算!!!!!!!!!!!!! 小編寫了兩個腳本,一個名字叫data-dos 一個名字叫gap.sh 第一個腳本是用來提取態密度數據的,腳本命令如下 a=` ...

VASP入門到精通:[7]VASP計算態密度

VASP入門到精通:[7]VASP計算態密度
這一節小編給示範計算態密度的過程 工具/原料 VASP,P4v.exe 方法/步驟 先講一下DOS,就是態密度,也就是每個軌道的電子云分布比例,通過態密度可以了解電子結構 VASP計算態密度,一般我們通過兩步計算, 一,優化計算 二,靜態計算 第一步設置INCAR如下 ISTART=0 ICHARG ...

VASP入門到精通:[20]計算聲子譜2

VASP入門到精通:[20]計算聲子譜2
之前介紹到怎麼去計算聲子譜,計算完成後,可以去分析聲子譜 工具/原料 VASP phonopy 方法/步驟 之前小編給大家介紹了怎麼樣去計算聲子譜,在14節有介紹,沒有看到的小夥伴可以去看一下 注意INCAR里不要多加入一些沒用的參數設置,這樣容易出錯,只要必須的參數設置就可以了,如小編上一節介紹的 ...

vasp入門到精通[36]查看原子變化幅度(手寫腳本)

vasp入門到精通[36]查看原子變化幅度(手寫腳本)
有時候大家會不會想看一下體系優化後的原子變化情況,這一節小編寫了個腳本,可以查看每個原子優化前後的位移 工具/原料 vasp,linux,python POSCAR,CONTCAR 方法/步驟 有時候大家會不會想看一下體系優化後的原子變化情況,這一節小編寫了個腳本,可以查看每個原子優化前後的位移就是 ...

vasp入門到精通[25] 做晶體形狀不變的優化計算

vasp入門到精通[25] 做晶體形狀不變的優化計算
這一節簡單講一下做晶體形狀不變的優化計算,也就是晶格比例不變的優化計算 工具/原料 vasp 方法/步驟 廢話不多說,先上INCAR: system=FeHoI ICHARG=2 IBRION =2 NSW =100 POTIM=0.1 NELM=140 EDIFF=1E-6 EDIFFG=-0.0 ...

VASP入門到精通[34]由能帶計算有效電子質量

VASP入門到精通[34]由能帶計算有效電子質量
先用小編之前做好的能帶計算實例算能帶教程,然後再看此教程比較好理解哦 工具/原料 VASP linux, band.x, gk.x 方法/步驟 先算好能帶,產生的highk.dat是高對稱點的坐標位置. 如上圖,這些位置就是能帶圖中對應的高對稱位置: 找到導帶底的位置,取其附近的點,小編取了9個點, ...

VASP入門到精通:[11]VASP計算能帶(3)

VASP入門到精通:[11]VASP計算能帶(3)
這節繼續來說一下能帶是怎麼出來的,嘻嘻 工具/原料 band.x 腳本,VASP 方法/步驟 上一節說到對於能帶的計算,參數如下 計算完成後,把band.x 腳本文件複製到能帶計算的文件夾中 然後給band.x開權限, chmod 777 band.x 然後就可以看到可執行腳本band.x變成綠色的 ...

VASP入門到精通:[4]一個簡單的VASP運行實例

VASP入門到精通:[4]一個簡單的VASP運行實例
這一節給大家一個簡單的實例,這裡就選擇優化CrI3 工具/原料 VASP 方法/步驟 做一個非磁的優化 第一步,寫入INCAR: ISTART=0 ICHARG=2 IBRION=2 NSW =60 NELM=40 EDIFF=1E-4 EDIFFG=-0.01 ISMEAR=0 SIGMA=0.0 ...

vasp入門到精通[21]畫出總態密度(手寫腳本)

vasp入門到精通[21]畫出總態密度(手寫腳本)
今天教大家寫腳本處理態密度! 工具/原料 vasp 方法/步驟 首先要知道態密度數據是在DOSCAR中的,讓我們先看一下裡面的結構 從第六行開始, 前兩個數據是能量範圍,第三個是NEDOS數,第四個是費米能級 我們的目標是把前兩列提取出來,而且提取的列數=NEDOS的值(INCAR中的參數)比如我的 ...

VASP入門到精通:[9]VASP計算能帶

VASP入門到精通:[9]VASP計算能帶
這一節介紹怎麼計算能帶 工具/原料 需要幾個腳本:gk.x 和 band.x 以及syml文件 方法/步驟 能帶跟DOS是對應的,通過能帶可以得到一些重要的電子結構信息 如上圖,左邊縱坐標是能量,橫坐標中豎線是高對稱點 在上一節,我們做了2步計算,分別是優化和自洽 INCAR 設置為: 第一步: I ...

VASP入門到精通[33]分子軌道-partial charge

VASP入門到精通[33]分子軌道-partial charge
這一節講一下怎麼使用vasp畫某些能級的分子軌道 工具/原料 vasp vesta 方法/步驟 優化完體系要做一步靜態計算,注意加上LWAVE=.TRUE. LCHARG = .TRUE. 參數如下: PREC = Accurate ENCUT = 400 EDIFF = 1e-5 EDIFFG=- ...

VASP入門到精通:[14]VASP計算聲子譜

VASP入門到精通:[14]VASP計算聲子譜
聲子譜是看體系能否穩定存在的一個重要指標,所以在計算中,聲子譜也是常用的一個計算 工具/原料 VASP phonopy 方法/步驟 聲子譜是一個重要參數,可以鑑定和預測體系是否穩定存在 安裝phonopy,這裡小編就不具體講了,不會的小夥伴等小編以後補上相關軟體的安裝就可以了,安裝好以後會出現如下界 ...

VASP入門到精通:[16]wannier與vasp實例

VASP入門到精通:[16]wannier與vasp實例
這一節介紹wannier接口VASP的計算實例.wannier用於計算能帶等信息有著較高的精度和準確度,配合vasp計算能夠更好地擬合能帶信息 工具/原料 VASP ,wannier 方法/步驟 這一節以Si為例來介紹使用wannier軟體結合vasp的使用方法 首先要做常規的vasp計算:優化,靜 ...

VASP入門到精通:[1]如何寫POSCAR

VASP入門到精通:[1]如何寫POSCAR
本系列將全面介紹VASP的使用和實例.小夥伴給贊就是小編的最大動力!!! 本節主要講怎麼寫POSCAR,怎麼用MS里建立的模型轉成POSCAR 工具/原料 VASP,VESTA,MS 方法/步驟 VASP軟體一般來說最簡單的輸入文件有: INCAR POSCAR POTCAR KPOINTS 還有如 ...

VASP入門到精通:[12]計算磁性體系

VASP入門到精通:[12]計算磁性體系
這裡小編介紹怎麼計算磁性體系的磁性耦合態 方法/步驟 計算磁性體系,首先要知道它的穩定態是什麼,一般第一步要進行優化 分兩步來看,第一,做非磁的優化和靜態計算,參數同前面小編的設置 按照上面的設置做一個非磁的計算,先看一下能量.接下來做磁性的計算: INCAR中磁性的計算要用ISPIN和MAGMOM ...

vasp入門到精通[31]計算缺陷(或固定原子)

vasp入門到精通[31]計算缺陷(或固定原子)
這一節講一下計算缺陷的例子,就是有的體系會出現空位.最常見的是氧空位.這一節以TiO2為例子介紹氧空位的計算. 主要是介紹小編寫的一個python腳本,怎麼去固定原子計算,固定原子計算,固定原子計算!!!(重要的事情說三遍) 工具/原料 vasp 方法/步驟 以TiO2為例子,單胞如下圖: 做養空位 ...

vasp入門到精通[23]計算團簇時候參數怎麼設置

vasp入門到精通[23]計算團簇時候參數怎麼設置
不知道有沒有小夥伴在使用vasp計算團簇,這裡給大家點小技巧 工具/原料 vasp 方法/步驟 建立模型,如果是單元素的模型,要看多少原子,原子多了,就有很多種對稱性的可能,vasp無法做到搜尋出基態,但是可以簡單的在小勢能範圍內搜尋 如下圖所示,小編做了個6個原子的結構,6個原子,一般是Oh(八面 ...

vasp入門到精通[29]自旋軌道耦合SOC

vasp入門到精通[29]自旋軌道耦合SOC
這一節講一下計算自旋軌道耦合的方法 工具/原料 vasp 方法/步驟 比一個6個原子的Mn原胞(),做SOC優化計算 POSCAR 和 INCAR參數如下圖,INCAR如下: SYSTEM=Mn6 ISTART=0 ICHARG=2 GGA=PE ENCUT=600 ISPIN=2 MAGMOM=3 ...

VASP入門到精通:[2]如何寫POSCAR補充

VASP入門到精通:[2]如何寫POSCAR補充
這裡補充一下POSCAR的寫法,怕有的小夥伴看不懂 工具/原料 VASP MS 方法/步驟 上一節講到如何生成.cell 文件,就是 modules---......--files--save files之後的內容 這裡小編要講一下,.cell 文件默認是隱藏的,大家要把文件夾屬性改一下.隱藏文件可 ...